一體化污水處理設備主要用來處理小水量生活污水以及低濃度的工業有機污水，由于該類產品采用機電一體化全封閉結構，無需專人管理，因面得到廣泛的使用。但是，本產品在運用過程中，應從安裝、運行、維護等幾個方面合理使用才能達到設計的處理效果
(1)設備的安裝一體化污水處理設備一般提供三種安裝方式：地理式、地上式和半地埋式，在選擇安裝方式時應結合當地的氣候以及周圍的環境，對于年平均氣溫在10℃以下的地區，用生物膜法處理污水的效果較差，應將污水處理設備安裝在凍土層以下，可利用地熱的保溫作用，提高處理效果：在其他地區選擇安裝方式主要根據周圍的環境來選擇，從安裝、維護角度出發應選擇地上式或半地埋式，從節省土地角度出發應選擇地埋式，如果對周圍環境影響不太大時應選地上式，因為地埋式存在如下問題：①設備安裝、維修、維護保養不方便；②設備可能因為進入基礎地下水的浮力作用而損壞；③在地下的電氣系統因長期處于潮濕環境會影響其使用壽命，電氣安全性也將受到影響
在設備安裝過程中，還應注意以下事項
①設備的混凝土基礎的大小規格應與設備的平面安裝圖相同，基礎的平均承壓必須達到產品說明書的要求，基礎必須水平，如設備采用地埋式安裝，基礎標高必須小于或等于設備標高，并保證下雨時不積水，為防止設備上浮，基礎應預埋抗浮環
②設備應根據安裝圖將各箱體依次安裝，箱體的位置、方向不能錯，彼此間距必須準確，以便連接管道，設備安裝就位后，應用緲帶把設備和基礎上的抗浮環連接。以防設備上浮
③為保證設備管路暢通，應按產品說明書要求保證某些設備或管路的傾斜度
④設備安裝后，應在設備內注人清水，檢查各管道有無滲漏，對于地埋式設備，在確定管道無滲漏后，在基礎內注入清水30~50cm深后，即在箱體四周覆土，一直到設備檢查孔，并平整地面
⑤在連接水泵、風機等設備的電源線時，應注意風機和電機的轉向。
(2)設備的調試一體化污水處理設備安裝完畢后可進行系統調試，即培養填料上的生物膜，污水泵按額定的流量把污水抽入設備內，啟動風機進行曝氣，每天觀察接觸池內填料的情況，如填料上長出橙黃或橙黑色的膜，表明生物膜已培養好，這一過程一般需要715d。如是工業污水處理設備，很好先用生活污水培養好生物膜后，再逐漸進工業污水進行生物膜馴化。
(3)設備的運行
體化污水處理設備一般為全自動控制或無動力型，不需要配備專門的管理人員，但在設備運行過程中應注意以下事項。
①開機時必須先啟動曝氣風機，逐漸打開曝氣管閥門，然后啟動污水泵(或開啟進水閥門)；關機時必須先關污水泵(或關閉進水閥門)，再關閉曝氣風機。
②如污水較少或沒有污水，為保證生物膜的正常生長，使生物膜不死亡脫落，風機可間歌啟動，啟動周期為2h。每次運行時間為30min。